A Neptunban olyan rendszerüzeneteket kaphat a felhasználó, amelyeknek megnyitása, olvasása nélkül nem léphet tovább, vagy bizonyos tevékenységeket nem végezhet a rendszerben. Például nem jelentkezhet fel további vizsgaalkalomra, amíg az utolsó vizsgalehetőségről szóló üzenetet el nem olvasta.